接續者上一章，接著就是住宿的部分，住宿的好壞會嚴重影響整個旅行的體力，因此追求好的住宿品質，是不能打折的，但是每個人對於旅館的需求及最低容忍度又不盡相同，預算上也是南轅北轍，一個人還算容易，兩人以上在旅館的挑選上，往往是困難且會產生爭執的，以下就簡單的介紹住宿幾個常見的類型。
(A)一般旅館
這是最常見的選擇，依照駕前的不同，從沒有星等到5星級旅館都有，大部分都有24小時的前台，不用擔心太晚check in或太早check out時，沒有人來服務，寄放行李也有人看管，服務好的還有收包裹的服務，以及代送行李的服務。在日本有許多的連鎖的商務旅館，例如APA、東橫INN、DORMY INN等等，都有自己的特色，而且離車站或是熱門的鬧區都很近，如果有基本的旅館服務需求，這些都是很好的選擇，當然預算許可的話，體驗湖岸邊、臨景等等超高級的旅館，也是非常推薦的。但是要注意的是日本的旅館很多都會把適合一個人140cm寬的床位當成兩人房來賣，也就是所謂的SEMI-DOUBLE的房間，如果你的身材高大、肩寬很長，或是很講究睡眠品質的人，兩人房的選擇請避免掉這一類的房間吧，雖然會便宜很多，但實際上這不是很好的選擇。
(B)青年旅館
青年旅館有給人是專門給預算不多年輕人住宿的選擇的預算，大部分也是像宿舍般，一間房間裡多個床位來賣的， 共用廁所及浴室 ，適合給預算不足或熱愛交友的旅人，通常會有一個交誼廳，讓來自不同的旅客能夠分享及聊天的地方，也有共用的廚房可以使用，但是晚上睡眠品質非常不好，因為容易被晚睡的人及早離開的人吵到，深夜的交響曲更是難以忍受，我曾經住過16人一間的青年旅館，晚上真的很可怕。其實有些青年旅館也是有獨立的房間，如果不太講究，或是預算稍微多一些的話，是可以選擇獨立房間的，如果一群人更可以包下一間宿舍房，來節省成本。選擇青年旅館的話就要比一般旅館多注意很多地方，主要是前台服務的時間、是否有門禁的時間、重要物品的管理、需要自理床單、行李寄放大都只是寄放並無人管理等等地方，如果能夠克服這些缺點也是不錯的選擇。
(C)膠囊旅館
基本上膠囊旅館可以說是青年旅館的特化版，為了旅館使用面積利用最大化的產物，基本上住宿的部分跟青年旅館很相近，但就少了人互動的空間，基本上比青年旅館的價格貴上一些，但是在房客上的管理比青年旅館嚴格多了，前台也比較有作用，雖然還比不上一般旅館。膠囊旅館基本上會強制要求房客在規定時間內離開旅館，之後再重新check in，這段空檔給工作人員打掃，如果有很多行李的旅客碰上櫃子很小的旅館就會非常頭痛，另外可以注意到膠囊旅館很多都只有男性限定，女行遊客的選擇相較少了很多選擇。雖然有些不方便及麻煩，但是還是有些特色膠囊旅館，可是非常有趣的，例如NINE HOUR，就像是體驗太空艙的感覺，非常推薦大家嘗試看看。
(D)民宿、溫泉旅館
如果要在旅遊中體驗到日本最道地的傳統住宿文化，就只有選擇這個選項，例如京都的町家、合掌造的各個民宿以及各個傳統的溫泉旅館，這類型的旅館，可以讓旅客最直接體驗到日本的文化，不用再考慮其他方案了。但是通常費用都會昂貴許多，住宿的規矩也比較多，另外因為很搶手的緣故，口碑好的旅館都是很難預定的，如果有附半食宿的話，對於用餐時間規定也很嚴格，如果遲到就很抱歉了，它不會等你的，雖然有這麼多規矩，但是住上一次就會上癮的，偶爾奢侈一點，讓自己享受一下吧。強力推薦這個選項。
(E)AIRBNB
如同各國的AIRBNB選項一樣，基本上就是擁有空房的房東，將自己的空房間分享出來的，好的房東讓你上天堂，不好的就會讓你有不同難忘的糟糕體驗，基本上日本在2018年6月14日頒布新的法規後應該就沒有非法的經營，但是PTT裡討論還是可以看到，有非法的部分。如果有太便宜的物件就自己好好評估一下，不要讓不好的住宿體驗毀了旅程。各個房東有不同的規定，訂房前請詳閱相關內容。
(G)網路咖啡店
最後一項網路咖啡店，如果要體驗的話可以嘗試看看，如果不是為了體驗的話，除非以經沒有其他旅館可以選擇的話，請不要放在你的計畫內，雖然旅館有附飲料、有提供盥洗，但是其實很不方便的，詳細的體驗再獨立一篇來描述。
建議再規劃旅館時，能夠盡早就盡早，尤其規劃在賞櫻期與賞楓期，請不要太晚，現在訂房網站大部分都可以提前預訂，而且可以免費取消，日本一般在3個月前就可以訂房，甚至有些可以到6個月前，但千萬注意不要貪一點便宜，就訂不能退費的旅館，最後會得不償失，還有請不要預定了人卻未到的，這是很失禮的。